استفاده از سه روش مولکولی متفاوت در شناسایی الگوی ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ژنوتایپ بیجینگ

نویسندگان

مهدی کاظم پور دیزچی

m. kazempour mycobacteriology research center (mrc), national research institute of tuberculosis and lung disease (nritld), shahid beheshti university medical campus, tehran, iranمرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی، پژوهشکده سل و بیماریهای ریوی، دارآباد، تهران محمدرضا مسجدی

m. r. masjedi the research center of tb and lung diseases, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iranدانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید بهشتی، مرکز تحقیقات سل و بیماری های ریوی علی اکبر ولایتی

a. a. velayati the research center of tb and lung diseases, shahid beheshti university of medical sciences, tehran, iranدانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی شهید بهشتی، مرکز تحقیقات سل و بیماری های ریوی الهه تاج الدین

e. tajeddin jahrom azad university of medical sciences, jahrom, iranدانشگاه آزاد اسلامی، واحد جهرم پریسا فرنیا

چکیده

سابقه و هدف: سویه بیجینگ بیش از 4/1 مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در سرتاسر جهان را تشکیل می دهد. این سویه ویژگی های مهمی از جمله داشتن ارتباط با مقاومت چند دارویی دارا می باشد. هدف از این مطالعه شناسایی الگوی ژنتیکی سویه های بیجینگ (beijing ) با استفاده از روش های اسپولیگوتایپینگ، تایپینگvariable number tandem repeat (vntr)و rflp-is6110 می باشد. مواد و روش ها: سویه کشت مثبت 238 مسلول ریوی (سال 1387-1386) با استفاده از روش اسپولیگوتایپینگ تعیین شد. سپس سویه های بیجینگ جدا شده به روش rflp و vntr مورد بررسی قرار گرفتند. آنالیز داده های rflp با استفاده از نرم افزار gel campair صورت گرفت و داده های اسپولیگوتایپینگ پس از مقایسه با اطلاعات موجود در بانک جهانی اسپولیگوتایپینگ (spoldb4) آنالیز شدند. با روش vntr تنوع آللی 9 لوکوس mptr-a) ، etr-a، etr-b، etr-c، etr-d، etr-e، etr-f، qub 11b،(qub3232 در سویه های بیجینگ بررسی شد. با استفاده از آزمون (hgi) hunter gaston index تنوع اللی هر یک از لوکوس ها در سویه های بیجینگ محاسبه گردید. یافته ها: روش اسپولیگوتایپینگ، 8 گونه مایکو باکتریوم توبر کلوزیس(ea12, ea13, t, u, haarlem cas 2, cas 1, beijing) را شناسایی کرد. با ا ستفاده از روش vntr typing ، لوکوس qub 3232 به عنوان لوکوس بسیار افتراق دهنده (hgi ≥ 0.6) و لوکوس هایetr-f ، etr-e و qub 11b به عنوان لوکوس های افتراق دهنده متوسط (hgi ≥ 0.4-0.6) و سایر لوکوس ها به عنوان ضعیف ترین لوکوس افتراق دهنده در سویه های بیجینگ ، شناسایی شدند. در روش vntr typing،10 سویه (77%) و در روش rflp، 13سویه از 13 سویه بیجینگ (100%) الگوی متفاوت از خود نشان دادند. نتیجه گیری: تنوع در الگوی ژنتیکی نشان دهنده فعال شدن مجدد (reactivation) در جمعیت مورد بررسی می باشد. به دلیل هزینه بالا و اتلاف وقت در روش rflp، می توان از روش vntr typing همراه با اسپولیگوتایپینگ برای مطالعات اپیدمیولوژی مولکولی سل استفاده کرد

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

استفاده از سه روش مولکولی متفاوت در شناسایی الگوی ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ژنوتایپ بیجینگ

سابقه و هدف: سویه بیجینگ بیش از 4/1 مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در سرتاسر جهان را تشکیل می‌دهد. این سویه ویژگی‌های مهمی از جمله داشتن ارتباط با مقاومت چند دارویی دارا می‌باشد. هدف از این مطالعه شناسایی الگوی ژنتیکی سویه‌های بیجینگ (Beijing ) با استفاده از روش‌های اسپولیگوتایپینگ، تایپینگvariable number tandem repeat (VNTR)و RFLP-IS6110 می‌باشد. مواد و روش‌ها: سویه کشت مثبت 238 مسلول ریوی (سال ...

متن کامل

مقایسه مدل ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیجینگ با سایر سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش MIRU-VNTR

زمینه: اخیراًٌ نشان داده شده است که سوش‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ژنوتایپ بیجینگ، رابطه مستقیمی با مقاومت دارویی دارند. بنابراین روشی ساده و سریع برای تشخیص و تمایز ایزوله‌های خانواده بیجینگ مورد نیاز می‌باشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی قدرت تمایز لوکوس‌های مختلف دو روش 15 MIRU-VNTR و 12 MIRU-VNTR برای سویه-های بیجینگ و مقایسه آن با سایر سویه‎های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس می‌باشد. مواد و روش‌ها...

متن کامل

مقایسه مدل ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیجینگ با سایر سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش miru-vntr

زمینه: اخیراًٌ نشان داده شده است که سوش های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ژنوتایپ بیجینگ، رابطه مستقیمی با مقاومت دارویی دارند. بنابراین روشی ساده و سریع برای تشخیص و تمایز ایزوله های خانواده بیجینگ مورد نیاز می باشد. هدف از این مطالعه، ارزیابی قدرت تمایز لوکوس های مختلف دو روش 15 miru-vntr و 12 miru-vntr برای سویه-های بیجینگ و مقایسه آن با سایر سویه‎های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس می باشد. مواد و روش ها...

متن کامل

تعیین ساختار ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش MIRU-VNTR

زمینه و هدف : روش MIRU-VNTR به یکی از فراگیرترین روش‌های استاندارد شده ژنوتایپینگ مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس تبدیل شده است. این مطالعه به منظور تعیین ساختار ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش MIRU-VNTR و نیز تعیین نقش اعضای دیگر مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس در ایجاد بیماری سل انجام گردید. روش بررسی : این مطالعه توصیفی روی 53 جدایه حاصل از کشت باکتریایی نمونه‌های خلط و لاواژ معدی بی...

متن کامل

شناسایی مقاومت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به ریفامپین توسط روش PCR

زمینه و هدف: مایکوباکتریوم توبرکلوزیس همچنان به‌عنوان شایع‌ترین علت مرگ‌های مرتبط با عوامل بیماریزای عفونی در جهان مطرح است. ریفامپین نیز از مهم‌ترین داروهای خط اول درمان بیماری سل می‌باشد. شایع‌ترین موتاسیون‌های مرتبط با مقاومت به داروی ریفامپین در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بر اثر جابه‌جایی در کدون‌های 531، 526 و 516 در ژن rpoB اتفاق می‌افتد. این مطالعه با هدف معرفی روش (Multiplex Allele Specif...

متن کامل

بررسی رابطه ژن‌های فسفولیپاز C با پاتوژنیسیته مایکوباکتریوم توبرکلوزیس سویه بیجینگ وسویه غیربیجینگ

Abstract Background: The Beijing strain of Mycobacterium tuberculosis is responsible for more than 25% of cases of Tuberculosis in the world, it has a high transmission potential and there is a significant correlation between Beijing strain and multidrug resistance. In this study we compared the presence of Phospholipase C genes in Beijing and Nonbeijing strains of Mycobacterium tuberculosis...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
کومش

جلد ۱۱، شماره ۱، صفحات ۷-۱۴

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023